Тестови на корону – шта је ЦТ вредност и како се тумачи
Пи-си-ар методом одређује се да ли је неко позитиван или негативан на коронавирус. Но, ЦТ вредност такође игра важну улогу. Шта ЦТ вредност заправо каже о степену заразе, али и о самом току болести?
ЦТ вредност је ознака повезана са тестом на корону. У основи, она показује количину вируса у узорку који је добијен брисом. Стручњаци расправљају о томе шта би то могло значити у погледу степена инфективности (заразности) пацијента и тока болести.
То није лако – да бисмо заиста разумели шта ова вредност значи, морамо детаљније погледати поступак који се примењује у пи-си-ар тесту.
Како функционише пи-си-ар?
Пи-си-ар тест се сматра најпоузданијим начином за откривање инфекције коронавирусом. Пи-си-ар је скраћеница за "Polymerase Chain Reaction" – полимеразну ланчану реакцију. То је молекуларно-биолошки процес који се користи за копирање делова ДНК помоћу њеног ензима полимеразе и каснију анализу.
Очишћени генетски материјал ставља се у пластичну епрувету са разним ензимима и ДНК компонентама – то се назива пи-си-ар приступ или пи-си-ар метода.
Епрувета се потом ставља у "thermocycler" – што је у основи комбинација шпорета и фрижидера. Овај уређај може подизати температуру у епрувети, онако како је претходно програмиран. То је важно, јер се копирање делова ДНК састоји од различитих корака, од којих се сваки одвија на различитим температурама и понавља у циклусима.
Двоструки ланац ДНА се више пута одваја и допуњава тако да се ДНК удвостручује у сваком циклусу. То је мање више све што се догађа током нормалног пи-си-ар процеса.
Које су посебне карактеристике корона пи-си-ара?
Коронавирус нема ДНК, већ РНК. Али то није проблем, јер постоје ензими који РНК преписују односно претварају у ДНК. То се дешава у једном кораку, пре него што почне пи-си-ар.
Пи-си-ар тестови, у којима се РНА транскрибује у ДНК, називају се РТ-пи-си-ар. Ознака РТ значи "Enzym Reverse Transcriptas", дакле ензим који РНК претвара у ДНК.
Корона тест има још једну посебност. Уобичајени пи-си-ар једноставно дуплицира ДНК, а генетски материјал се анализира након пи-си-ар. За разлику од њега, корона пи-си-ар садржи флуоресцентне сонде. Ове сонде су усмерене на одређени циљни ген у вирусу. Тек кад се сонда веже за циљни ген, почиње да светли.
Овај сјај се може измерити фотометром у термичком циклусу и очитати на компјутеру. На тај начин током пи-си-ара можете видети да ли су гени вируса присутни у узорку. То се може видети у стварном времену. Због тога се овај облик пи-си-ара назива "real time PCR".
Колико су поуздани ови тестови?
Тачност пи-си-ар теста у Немачкој је врло висока. Инфекције се откривају у 98 посто случајева. Да би били двоструко сигурнији, већина узорака такође се испитује са два различита циљна гена, односно две различите флуоресцентне сонде.
"Real time PCR" је стандардни алат за дијагностиковање вируса. Користи се, на пример, и за тестирање дониране крви на вирусе ХИВ-а или хепатитиса.
Шта је ЦТ?
ЦТ је ознака за "Cycle Threshold", којим се описује број циклуса у којима је изведен "Real time PCR", пре него што се мери флуоресценција. Тај процес траје дуже, што је мање генома вируса у пластичној епрувети на почетку пи-си-ара.
Висока ЦТ вредност стога указује на ниско вирусно оптерећење узорка. Нажалост, висока вредност ЦТ-а не значи директно низак ризик од инфекције других људи. То је због различитих фактора које ћемо овде навести.
Проблем са стандардом
Не постоји јединствена, стандардизована вредност ЦТ којом се особа која је позитивно тестирана више не сматра инфективном. Један од разлога је тај што постоји много различитих тестова који су усмерени на различите циљне гене и чије се пи-си-ар методе помало разликује. Тиме се такође прави разлика по питању која количина вируса доводи до одређене вредности ЦТ-а.
Студије Института "Роберт Кох" показале су да се корона вируси са ЦТ вредношћу 30 више не могу репродуковати у лабораторији. Ово такође говори да не постоји ризик да се заразите од особе од које потиче узорак дат на анализу.
Студије у Великој Британији показале су, међутим, да се чак и са ЦТ вредношћу већом од 35, осам посто узорака у лабораторији и даље може репродуковати. То значи да би особе са том ЦТ вредношћу и даље могле бити заразне.
Занимљиво је да чак и исти тест може дати различите резултате у различитим лабораторијама. Дакле, не постоји јасна ЦТ вредност из које се може извући закључак да је особа позитивна на корону, али не и заразна.
Поготово на почетку болести изазване короном, вирусно оптерећење особе и даље може бити врло мало. Свако ко на почетку инфекције направи тест који има високу ЦТ вредност, неколико дана касније може бити јако заразан.
Резултат пи-си-ар теста стога треба увек посматрати заједно с могућим симптомима. Контакти са људима који су више изложени ризику заразе или боравак у ризичним подручјима такође играју улогу у тумачењу теста.
Висока ЦТ вредност значи да је испитивани узорак садржавао мало вируса. Међутим, то не значи да сам пацијент има ниско вирусно оптерећење. Многи фактори могу утицати на количину вируса у узорку. На пример, како је узет брис, колико је узето узорака, како је узорак сачуван и транспован. Постоје и флуктуације у зависности од тога са којег места у носу и устима је узет брис.
Закључак – вредност ЦТ-а не говори ништа поуздано о томе колико је неко заразан. Међутим, важан је показатељ у тренутку када лекар тумачи налазе.
Коментари